Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAPRE3Q9UPY8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAPRE3Q9UPY8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms