Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms