Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPCN1Q9ULQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPCN1Q9ULQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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