Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.07□□□□□ -2.45e-24■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt18.01■□□□□ 0.475e-38■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.87□□□□□ -1.315e-38■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.368e-10■□□□□ 11
AATFQ9NY61 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.448e-10■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 11
AATFQ9NY61 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 226.28■■□□□ 1.81e-9■□□□□ 11
AATFQ9NY61 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-9■□□□□ 11
AATFQ9NY61 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-9■□□□□ 11
AATFQ9NY61 KIAA0232-204ENST00000503278 563 ntTSL 44.21□□□□□ -1.741e-9■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 527.19■■□□□ 1.941e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.611e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.521e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.231e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.231e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.171e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 518.68■□□□□ 0.581e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.311e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 511.61□□□□□ -0.551e-323■□□□□ 11
AATFQ9NY61 TCP1-217ENST00000546023 1135 ntTSL 1 (best)30.88■■■□□ 2.532e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PMS2P3-205ENST00000437568 1185 ntTSL 530.72■■■□□ 2.512e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 429.78■■■□□ 2.362e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PMS2P3-202ENST00000418756 1490 ntTSL 328.34■■■□□ 2.132e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PMS2P3-201ENST00000394921 1316 ntTSL 228.11■■■□□ 2.092e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-209ENST00000538128 557 ntTSL 427.79■■■□□ 2.042e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.872e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 DLK1-204ENST00000555747 538 ntTSL 425.59■■□□□ 1.692e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-212ENST00000483451 1119 ntTSL 524.55■■□□□ 1.522e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.512e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-208ENST00000537390 691 ntTSL 523.88■■□□□ 1.412e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-213ENST00000543517 561 ntTSL 423.29■■□□□ 1.322e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 522.38■■□□□ 1.172e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-206ENST00000536607 572 ntTSL 222.1■■□□□ 1.132e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 421.68■■□□□ 1.062e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PMS2P3-204ENST00000430602 1005 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 419.57■□□□□ 0.722e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 519.53■□□□□ 0.722e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 419.08■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 419.04■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-210ENST00000538530 918 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-211ENST00000539756 780 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-211ENST00000481136 674 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-217ENST00000494502 757 ntTSL 510.89□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 48.59□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 44.44□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-209ENST00000475915 849 ntTSL 53.4□□□□□ -1.872e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-215ENST00000492139 686 ntTSL 53.29□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.952e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 PDCD10-205ENST00000464360 585 ntTSL 32.43□□□□□ -2.022e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 41.78□□□□□ -2.122e-7■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.391e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SNHG20-205ENST00000568363 786 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.141e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.091e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.091e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 214.42□□□□□ -0.11e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SNHG20-201ENST00000366365 1028 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC11.78□□□□□ -0.521e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.261e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.671e-13■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.035e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.135e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 319.52■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 219.02■□□□□ 0.645e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 10.9
AATFQ9NY61 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-28■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-28■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)19.27■□□□□ 0.681e-9■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 222.93■■□□□ 1.267e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 222.83■■□□□ 1.257e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-210ENST00000541645 548 ntTSL 221.71■■□□□ 1.077e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 520.77■□□□□ 0.927e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.557e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 TMC6-214ENST00000590162 517 ntTSL 218.3■□□□□ 0.527e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 218■□□□□ 0.477e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-203ENST00000535859 582 ntTSL 216.71■□□□□ 0.277e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-207ENST00000540351 622 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.147e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-212ENST00000544481 477 ntTSL 415.81■□□□□ 0.127e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-202ENST00000535131 563 ntTSL 515.49■□□□□ 0.077e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 UBC-209ENST00000541272 582 ntTSL 514.38□□□□□ -0.117e-8■□□□□ 10.8
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 137.2 ms