Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD1Q9H3U5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms