Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APIPQ96GX9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms