Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BICD1Q96G01 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BICD1Q96G01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms