Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms