Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBL4BQ8N7F7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms