Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKAP1Q86WV1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP1Q86WV1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms