Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC8DQ7L1W4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1080.5 ms