Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms