Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms