Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDRF1Q3B7T1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDRF1Q3B7T1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDRF1Q3B7T1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms