Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYSND1Q2T9J0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms