Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q1T7F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q1T7F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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