Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTPRNQ16849 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PTPRNQ16849 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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