Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 216.8■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TMEM214-207ENST00000444135 919 ntTSL 516.73■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 216.21■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 315.94■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 415.29■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 THEM6-203ENST00000520217 551 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AAMP-203ENST00000422731 742 ntTSL 314.49□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-207ENST00000528741 719 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 213.32□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 512.85□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 TMEM214-204ENST00000425720 740 ntTSL 511□□□□□ -0.653e-22■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 SLC35F6-203ENST00000429494 3738 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 310.74□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 SLC35F6-202ENST00000414029 3605 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 56.73□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 CTSH-212ENST00000530929 479 ntTSL 35.22□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 AC008760.2-201ENST00000614781 1357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.555e-30■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.41e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.141e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.961e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 316.85■□□□□ 0.291e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-213ENST00000473074 943 ntTSL 515.44■□□□□ 0.061e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-8■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 DCAF15-202ENST00000585468 815 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.897e-9■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 GDI1-214ENST00000491154 4069 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.196e-12■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.016e-12■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 510.29□□□□□ -0.766e-12■■■■□ 23.3
PCBP1Q15365 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 519.83■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 NPRL3-203ENST00000422814 512 ntTSL 419.83■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 314.25□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 512.15□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 PRCC-206ENST00000491853 833 ntTSL 313.95□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 PRCC-205ENST00000473387 452 ntTSL 27.18□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 ZYX-206ENST00000449630 533 ntTSL 420.56■□□□□ 0.883e-8■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.492e-9■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-9■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-9■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-9■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.134e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 KMT2B-205ENST00000606995 195 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SSRP1-204ENST00000529002 648 ntTSL 521.04■□□□□ 0.965e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 215.67■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-6■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.793e-14■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-14■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.486e-8■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 RTL8C-203ENST00000495563 578 ntTSL 512.8□□□□□ -0.366e-8■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 RTL8C-202ENST00000464369 616 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 23.2
PCBP1Q15365 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 GABBR1-208ENST00000472823 4286 ntTSL 518.78■□□□□ 0.65e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 514.34□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-12■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 523.86■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 523.62■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 316.04■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 215.32■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 313.71□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 23.1
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