Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK3Q15120 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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