Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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GTF2H3Q13889 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GTF2H3Q13889 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2H3Q13889 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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