Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP1A4Q13733 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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