Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-78■■■■■ 27
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PABPC4Q13310 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 26.12□□□□□ -1.432e-78■■■■■ 27
PABPC4Q13310 TBL2-203ENST00000424598 2276 ntTSL 226.31■■□□□ 1.88e-9■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.758e-9■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 TBL2-209ENST00000450285 2209 ntTSL 1 (best)24.48■■□□□ 1.518e-9■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.528e-9■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 TBL2-213ENST00000459913 2358 ntTSL 515.68■□□□□ 0.18e-9■■■■■ 26.9
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PABPC4Q13310 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-50■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-50■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 312.62□□□□□ -0.392e-50■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-50■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 210.86□□□□□ -0.672e-50■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 26.9
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PABPC4Q13310 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.254e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.254e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.774e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 58.29□□□□□ -1.084e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 MPC1-203ENST00000366868 572 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 53.17□□□□□ -1.94e-11■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 REEP6-204ENST00000591735 1026 ntTSL 226.42■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.498e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.158e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.068e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.078e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.088e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.198e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.48e-13■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.026e-9■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 313.28□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 26.9
PABPC4Q13310 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.84■■□□□ 1.731e-23■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.281e-23■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.51e-13■■■■■ 26.8
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PABPC4Q13310 ALKBH5-202ENST00000490106 2146 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 UBE2V2-206ENST00000521628 1033 ntTSL 26.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 423.25■■□□□ 1.317e-22■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.257e-22■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 526.94■■□□□ 1.92e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 226.84■■□□□ 1.892e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.892e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.82e-10■■■■■ 26.8
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PABPC4Q13310 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 26.8
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PABPC4Q13310 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 26.8
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PABPC4Q13310 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.894e-9■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 26.8
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PABPC4Q13310 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.848e-10■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 ARL6IP4-213ENST00000536073 562 ntTSL 223.5■■□□□ 1.357e-7■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.283e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.983e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.589e-14■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.389e-14■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.389e-14■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.263e-8■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.929e-14■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.29e-14■■■■■ 26.8
PABPC4Q13310 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.246e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-209ENST00000560013 1868 ntTSL 226.28■■□□□ 1.86e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 VAT1-208ENST00000590924 613 ntTSL 321.79■■□□□ 1.086e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.996e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.186e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 VAT1-206ENST00000589709 570 ntTSL 414.9□□□□□ -0.026e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-208ENST00000559891 2133 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.286e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.376e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-215ENST00000561373 1734 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.396e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-203ENST00000428002 1267 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.416e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TM2D3-204ENST00000558129 864 ntTSL 311.57□□□□□ -0.566e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 VAT1-207ENST00000589828 521 ntTSL 29.94□□□□□ -0.826e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.056e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.196e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.216e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 37.14□□□□□ -1.276e-8■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPL30-210ENST00000521534 573 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-20■■■■□ 26.7
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