Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLN3Q13286 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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