Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBX1P62877 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBX1P62877 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms