Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms