Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS2P61201 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS2P61201 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS2P61201 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS2P61201 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS2P61201 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS2P61201 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS2P61201 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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