Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB2AP61019 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms