Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms