Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AFDNP55196 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AFDNP55196 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
AFDNP55196 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms