Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTRLP40313 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTRLP40313 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTRLP40313 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTRLP40313 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRLP40313 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms