Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF4P23510 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF4P23510 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms