Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMSP20962 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMSP20962 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMSP20962 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMSP20962 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMSP20962 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTMSP20962 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTMSP20962 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTMSP20962 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMSP20962 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMSP20962 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMSP20962 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTMSP20962 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTMSP20962 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMSP20962 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTMSP20962 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms