Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTLA4P16410 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms