Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDPSP14324 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDPSP14324 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDPSP14324 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDPSP14324 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FDPSP14324 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FDPSP14324 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FDPSP14324 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDPSP14324 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDPSP14324 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDPSP14324 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDPSP14324 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms