Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLBP1P12271 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms