Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMCP01189 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMCP01189 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMCP01189 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POMCP01189 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POMCP01189 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POMCP01189 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMCP01189 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMCP01189 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POMCP01189 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMCP01189 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms