Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms