Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB3O75712 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB3O75712 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB3O75712 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB3O75712 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB3O75712 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB3O75712 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB3O75712 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB3O75712 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB3O75712 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB3O75712 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB3O75712 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms