Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPX2O60687 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPX2O60687 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPX2O60687 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPX2O60687 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPX2O60687 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms