Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A2O14975 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms