Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3KT08 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
J3KT08 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
J3KT08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
J3KT08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
J3KT08 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3KT08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms