Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms