Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.742e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 SLC7A6-215ENST00000568088 510 ntTSL 325.67■■□□□ 1.71e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 SLC7A6-208ENST00000564708 547 ntTSL 319.58■□□□□ 0.721e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.333e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.233e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 FUBP1-212ENST00000492405 668 ntTSL 313.18□□□□□ -0.33e-20■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 FUBP1-210ENST00000488814 612 ntTSL 36.65□□□□□ -1.343e-20■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 INTS8-219ENST00000523998 536 ntTSL 43.37□□□□□ -1.874e-10■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 TKT-209ENST00000466765 693 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 49.79□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 58.97□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 47.16□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 45.79□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.761e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-10■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-10■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-10■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 FLVCR1-202ENST00000419102 1108 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.016e-7■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 EFEMP2-212ENST00000529870 811 ntTSL 219.43■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 PXDC1-203ENST00000477592 1697 ntTSL 517.61■□□□□ 0.416e-7■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 SNHG14-222ENST00000557108 3210 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 ATP1B3-207ENST00000484727 657 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-15■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 ATP1B3-208ENST00000486782 229 ntTSL 23.85□□□□□ -1.791e-15■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 TMEM45B-205ENST00000529381 515 ntTSL 25.62□□□□□ -1.516e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 TMEM45B-203ENST00000525709 247 ntTSL 54.52□□□□□ -1.696e-8■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.758e-9■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 CNOT11-202ENST00000420107 552 ntTSL 25.15□□□□□ -1.598e-9■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-323■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.41e-323■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 IFNGR1-203ENST00000458076 753 ntTSL 315.23■□□□□ 0.033e-9■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 CNOT2-215ENST00000548863 737 ntTSL 33.37□□□□□ -1.873e-9■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.742e-13■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.872e-13■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 KLC4-206ENST00000460283 550 ntTSL 419.57■□□□□ 0.723e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-206ENST00000560025 923 ntTSL 318.07■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.422e-13■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 GTPBP3-220ENST00000599429 592 ntTSL 416.99■□□□□ 0.313e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 KLC4-218ENST00000481888 549 ntTSL 216.66■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-13■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TBX3-204ENST00000552054 1814 ntTSL 215.96■□□□□ 0.143e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PLXND1-217ENST00000515191 602 ntTSL 415.21■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 GTPBP3-219ENST00000599329 582 ntTSL 315.02■□□□□ -03e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 ARHGEF16-206ENST00000464620 1403 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 214.33□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-204ENST00000546619 549 ntTSL 414.09□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-13■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-217ENST00000549935 2112 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 MST1-219ENST00000494828 621 ntTSL 413.33□□□□□ -0.283e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 ZMIZ2-214ENST00000492558 382 ntTSL 313.3□□□□□ -0.283e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 313.01□□□□□ -0.334e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-207ENST00000547949 532 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-203ENST00000557885 659 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 MST1-206ENST00000481055 597 ntTSL 512.42□□□□□ -0.423e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 MST1-213ENST00000490966 829 ntTSL 512.08□□□□□ -0.483e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-207ENST00000561398 797 ntTSL 311.49□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-208ENST00000547988 1277 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 ARHGEF16-204ENST00000418137 576 ntTSL 410.56□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)10.45□□□□□ -0.743e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-222ENST00000553154 566 ntTSL 29.79□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 MAP4-213ENST00000477765 284 ntTSL 39.69□□□□□ -0.863e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-213ENST00000549349 586 ntTSL 49.44□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TGIF2-205ENST00000558465 785 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 KLC4-214ENST00000472792 577 ntTSL 39.31□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-209ENST00000548177 567 ntTSL 49.31□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-216ENST00000549784 746 ntTSL 49.26□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-212ENST00000549173 554 ntTSL 49.15□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-219ENST00000551900 559 ntTSL 49.15□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-205ENST00000546774 733 ntTSL 27.75□□□□□ -1.173e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 27.51□□□□□ -1.216e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-211ENST00000548431 612 ntTSL 27.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-215ENST00000549688 549 ntTSL 47.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 ATG2A-206ENST00000472525 515 ntTSL 26.85□□□□□ -1.313e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 MAP4K4-214ENST00000477711 606 ntTSL 26.85□□□□□ -1.313e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-206ENST00000547885 555 ntTSL 46.84□□□□□ -1.313e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 RPS4Y1-202ENST00000430575 811 ntTSL 35.29□□□□□ -1.563e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NKTR-217ENST00000498730 4912 ntTSL 23.98□□□□□ -1.773e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NKTR-210ENST00000466553 716 ntTSL 23.91□□□□□ -1.783e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 GNPNAT1-202ENST00000553987 234 ntTSL 53.83□□□□□ -1.83e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CALCOCO1-221ENST00000552623 551 ntTSL 43.82□□□□□ -1.83e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.823e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.42□□□□□ -2.023e-7■□□□□ 10.1
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