Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D7

PAM16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAM16Q9Y3D7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAM16Q9Y3D7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms