Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms