Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPX2Q9ULW0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPX2Q9ULW0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms