Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms