Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms