Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCOCQ9UIL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms