Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms